Ecclesiasticamente il territorio di Ome fece parte fino al sec. XVI della pieve di Iseo, la quale vi amministrò due diaconie o case della carità dedicate l’una a S. Lorenzo, nel punto ove la via di comunicazione tra Franciacorta e le Valli si addentra fra le montagne, forse a servizio dei viandanti, e l’altra a S. Stefano protomartire che sorgeva al centro della valle più ampia un tempo emergente fra le paludi e le ultime propaggini dei monti, luogo certo più adatto agli scambi dei prodotti delle due aree.

Queste due chiese diaconali restarono tra di loro legate anche in modo giuridico con unica titolarità dei loro beni e assicurarono per almeno cinquecento anni il servizio di culto e carità alle popolazioni locali ed ai viandanti, fino a quando l’accresciuto spostamento di beni e di persone aprì nuovi assi stradali.

Una vera comunità parrocchiale si dovette formare, forse tra i sec. XIII-XIV intorno alla diaconia e cappella di S. Stefano e come tale è registrata nel Catalogo Capitolare dei Benefici del 1410 valutata sulle 18 lire, e con beneficio di lire una e 12 soldi. Nei secoli XIV-XV venne costruita la chiesa di cui rimangono resti nel muro sotto l’organo. La vitalità della comunità parrocchiale è confermata dalla presenza fin dai primi decenni del ‘500 della Scuola del Corpo di Cristo, la Scuola della Concezione (documentata dal 1542) poi trasformatasi nel 1587 in quella del Rosario (1587). S. Carlo Borromeo nella sua visita trovò operante la Scuola della Dottrina Cristiana che il vescovo Vincenzo Giustiniani nel 1637 dichiarerà ben funzionante.

Nel 1598 si formò la Compagnia di S. Angelo e delle Dimesse. Il parroco don Agostino Nassini (1572-1582) riordinò e rivide l’amministrazione parrocchiale compilando nel 1577 un completo inventario. I primi decenni del ‘600 videro continui passaggi di truppe mentre nel 1630 scoppiò la peste che dimezzò la popolazione scesa da 1400 nel 1610 a 700 nel 1648. Contro la pestilenza Ome ricorse più volte alle promesse a Dio: il 20 gennaio 1622 si era deciso con voto di solennizzare le feste di S. Fabiano e Sebastiano, S. Giuseppe, S. Bernardo, S. Savino e Cipriano, S. Rocco, S. Carlo. Nel 1630 vennero confermate con voto della Comunità che aggiunse anche il Venerdì santo, S. Pietro Martire e S. Manetto (dell’Ordine dei Servi di Maria). Il primo novembre 1648 si rinnovò il voto di santificare anche S. Bernardo Abbate. In questa situazione presero vita la Confraternita del Suffragio e più tardi la Confraternita dei Tridui dei Defunti (almeno dal 1693). Dal 1691 è documentata la confraternita dei «Devoti di S. Gaetano» per i quali si celebravano novene e la messa solenne nel giorno della sua festa (7 agosto). Opere di carità contrassegnarono la vita della parrocchia nel sec. XVIII. Anche dopo le soppressioni del 1797 le Confraternite locali non trascurarono gli oneri di culto elencati nei registri delle Messe.

Con l’assestamento politico del 1815 la vita religiosa ebbe uno sviluppo di tipo devozionale (privato o in associazioni). Le Confraternite si adattarono con una certa lentezza e fra mille difficoltà alla situazione derivante dalle soppressioni, dall’estinzione naturale, dalle trasformazioni della religiosità che però avvertiva l’esigenza di aggregarsi per idealità religiose, formative e caritative. La Confraternita del Santissimo (autorizzata a ricostituirsi dall’autorità governativa il 16.12.1817 e dal Vescovo Nava il 5.6.1821) continuò ancora la devozione eucaristica, le processioni e specialmente le 40 Ore (l’ultima settimana di agosto dalla fine del secolo XVIII), sosteneva iniziative di culto specie con l’invito di valenti predicatori, spese per mortaretti, processioni e arredi sacri.
Nel 1839 si stabilirono le nuove «Regole della Confraternita del Santissimo Sacramento eretta in Ome» che denunciano la perdita delle caratteristiche antiche orientandosi a servizi liturgici e alla promozione di pratiche di pietà. La Dottrina Cristiana era organizzata con «interrogazioni ai fanciulli sulle cose necessarie e poi si spiega nel Catechismo più diffusamente qualche punto di Dottrina». Nel 1841 si annotava che «La Dottrina cristiana è ben diretta ed assai frequentata. Non si conoscono abusi nè negligenze; si fa per via d’interrogazione ai fanciulli e per istruzione agli adulti».

La Confraternita del santo Rosario proseguì la sua attività per tutto il secolo come testimoniano i registri delle messe e gli atti delle Visite pastorali. La Confraternita di S. Luigi fu attiva fino al 1886 proseguendo però fino ad anni recenti la celebrazione della festa del Santo. La Confraternita di S. Gaetano conservò la sua festa annua (dal 7 agosto 1786) “per i devoti di S. Gaetano” almeno fino al 1858. Superata la crisi della rivoluzione giacobina la parrocchia riprese la sua vitalità. Già nel 1812 p. Fortunato Redolfi fondava nella chiesa della Valle la Confraternita di S. Luigi Gonzaga trasferita poi nella parrocchiale nel 1859. Le Confraternite si trasformarono in aderenza ai nuovi tempi: il Santissimo Sacramento si orientò a promuovere servizi liturgici e pratiche di culto (Adorazione perpetua 1883 e le Lampade viventi dal 1938). Quella del Rosario fu di nuovo eretta (1890) durando fino al 1906. La Confraternita di S. Gaetano, scomparve nella seconda metà del secolo scorso sostituita dalla moderna S. Vincenzo parrocchiale dedita alle attività caritative e assistenziali della parrocchia. Il contatto dei credenti con le situazioni nuove si arricchì di attività in cui si integrarono culto, formazione e impegno sociale fatto di carità e talvolta di lotta per far riconoscere nella società i valori cristiani. In tal senso localmente agirono la Confraternita Aiuto dei Cristiani (dal 1866); l’Associazione degli uomini e delle donne, rami del Comitato Parrocchiale (dal 1883) per la difesa della famiglia; l’Associazione del S. Cuore di Gesù e di Maria (dal 1881); l’Associazione di S. Carlo (fine secolo) e di S. Erasmo; i Terziari francescani; la Compagnia delle Dimesse ricostituita (1877) dal parroco don Crescini e impegnata nell’Oratorio femminile fondato nel 1882 con sede nella chiesa dei Morti e che nutrì entusiasmi e sostenne la tensione spirituale e morale di tante generazioni di ragazze e di madri di famiglia con catechismo, esercizi spirituali, istruzione, celebrazioni specie nella festa di S. Angela Merici e uso educativo del tempo libero specie mediante il canto e le recite di teatro. Assieme ad una più specifica attività socio-economica alla quale si è accennato, il parroco don Gozio (1887-1933) diede consistenza al lavoro avviato dai predecessori sviluppando la catechesi e nel 1889 riorganizzò la Scuola della Dottrina Cristiana che rimase quasi immutata fino agli anni ’20. La parrocchia fu tra le prime nel 1903 ad aderire alla Federazione Giovanile Leone XIII e a costruire poi nel settembre 1911 il «Circolo Cattolico S. Stefano» caratterizzato da intensa attività con riunioni, dibattiti, comizi; vi si tenne il Primo Convegno Collegiale di tutte le Associazioni e istituzioni Cattoliche del Collegio di Iseo (15 ottobre 1911) e nel 1912 costruì la sala che fu il centro educativo e di incontro della gioventù e uomini fino agli anni ’60, demolita nel 1978 per fare posto al nuovo Oratorio. A fronte del circolo S. Stefano si costituì un circolo laico denominato «Circolo Popolare Democratico» che ebbe scarsa vitalità e pose una lapide sulla facciata del Municipio (29 ottobre 1911) a ricordo dei combattenti Omesi in Libia.

All’inizio del secolo si avvertì anche l’urgenza di una scuola per bambini in età prescolare ancora affidati alla scuoletta. Specialmente ad opera del parroco Pietro Gozio e di don Stefano Borboni nel 1925 si costruì l’Asilo grazie alla generosità della popolazione che contribuì con offerte, lavoro volontario ed altre iniziative (raccolta delle uova, pesche di beneficenza, rappresentazioni della Filodrammatica maschile e femminile) per saldare i debiti incontrati e le spese di gestione dell’Asilo che non aveva redditi propri.

La scuola fu affidata alle Suore Maestre di Santa Dorotea di Brescia (1925-1958) che si impegnarono anche nella formazione della gioventù femminile con l’attività oratoriana. Attivo fu il parrocchiato di don Iottini che con la collaborazione del curato don Ilario Vivenzi operò per il benessere socio economico del paese; avviò una scuola di confezione (1952), il Circolo Acli e servizi di patronato (1958), i rami dell’Azione Cattolica, il nuovo Oratorio costruito con l’aiuto della benefattrice Gosio Teodora ved. Borboni (1952-1955) mentre dal 1958 al 1974 le Suore Misericordiose presero servizio all’asilo che si aggiornò ai nuovi orientamenti scolastici.
Anche il parrocchiato di don Rota nei suoi 27 anni fu ricco di iniziative religiose e di opere esterne: 1952-55 campo sportivo e Oratorio; 1956 cinema teatro offerto da don Carlo Forelli; costruzione della «Casa della Giovane»(Casa S. Angela) ad opera di Marina Negrini inaugurata il 18.10.1964 e fino alla sua morte (28.3.1976) centro fiorentissimo di attività formative, catechistiche, spirituali, accogliendo anche l’Oratorio maschile e femminile dopo che le Suore avevano lasciato l’Asilo nel 1973. Nel 1981 si inaugurava il primo lotto del nuovo Oratorio e nel 1986 si completava l’edificio; nel 1992 il nuovo campo sportivo e area circostante. Le attività del Cenacolo o Casa madre della Piccola Famiglia Francescana, fondata da padre Ireneo Mazzotti offrono ritiri ed esercizi spirituali e larga ospitalità a gruppi e parrocchie. Nel frattempo Casa S. Angela veniva dall’Associazione “Don Carlo Forelli” riadattata per ospitare l’associazione parrocchiale anziani e come punto di riferimento del “Progetto Ome” . Si ripetono dal 1987 il Presepio vivente mentre nel 1989 è stata riproposta la Passione di Cristo, già rappresentata nel 1928 dagli abitanti di Cerezzata